عقبات عدة وضعت أمام تطبيق قانون الوصفة الطبية الموحدة: أولها كانت عقدة الضمان الإجتماعي الذي يرفض تغيير الدواء، عقدة شدد وزير الصحة على أنّها حلّت، مصعّداً موقفه في وجه نقابة الأطباء بالقول: الوصفة الطبية الموحدة مقابل فصل أتعاب الأطباء عن المستشفيات.
