يتمتع الليمون الحامض بمزايا وخصائص كثيرة مفيدة لصحة الجسم لا يمكن تجاهلها، كغناه بالفيتامين C ودوره في تقوية جهاز المناعة. كما أهميته في المساعدة على تخلص الجسم من السموم، وغيرها من الفوائد المعروفة.
لكن لليمون الحامض أيضاً آثار جانبية يمكن أن تنتج عن تناوله بطريقة عشوائية، كالمشاكل التي يمكن أن يتسبب بها في المعدة، رغم أنه يساعد على تسهيل الهضم والمساعدة على التخلص من السموم، شرط أن يتم تناوله بطريقة صحيحة وأن يكون الجسم قادرا على تحمل معدل الحموضة.
كما أن الليمون الحامض يزيد الإحساس بالبرد. من هنا الاحساس بالانتعاش لدى تناوله في أيام الطقس الحار، ما قد يجعله غير مناسب لأيام البرد الشديد. والأمر يختلف من شخص إلى آخر بحسب نشاط الكبد.
ويسبب الإكثار العشوائي من تناول الليمون الحامض بتحسس الأسنان. وأظهرت بعض الدراسات أنه يسبب اهتراء الإسنان ونزف اللثة ان تخطى تناوله حدوداً معينة.